健康城市:应对新冠疫情专栏

【数据分享】COVID-19疫情时空数据集及典型应用丨城市数据派

【数据分享】COVID-19疫情时空数据集及典型应用丨城市数据派


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【本期看点】
自2019年12月中国湖北省武汉市出现首例新型冠状病毒(COVID-19)患者以来, COVID-19疫情受到了全球各科研工作者的广泛关注。然而,当前尚没有一个官方的渠道对COVID-19疫情数据进行实时开源,为了促进全球科学家为本次疫情建言献策,本研究旨在为广大科研工作者提供权威的、开放的和多尺度的新型冠状病毒(COVID-19)时空数据集,为疫情监测、防控、预测和预警提供重要的数据来源。此外,该数据集还能应用于COVID-19疫情的多尺度、多时相制图和可视化,为疫情的空间分布、演化、趋势分析和模拟预测提供指导。

本期投稿

【数据分享】COVID-19疫情时空数据集及典型应用丨城市数据派


撰写人:林浩
摄影测量与遥感专业
研究方向:VGI、OSM数据质量评价、
空间数据挖掘与分析、道路网模式挖掘。

数据集制作团队
鲍君雅,中国地质大学(武汉)地理与信息工程学院研究生
林浩,中国地质大学(武汉)地理与信息工程学院研究生
周琪, 中国地质大学(武汉)地理与信息工程学院副教授


引   言
【数据分享】COVID-19疫情时空数据集及典型应用丨城市数据派

自2019年12月以来,湖北省武汉市出现首例不明原因的肺炎患者(被诊断为感染新型冠状病毒,COVID-19),截止2020年2月20日,全球已有25个国家确诊感染COVID-19病毒累计74677例,死亡2122例。随着疫情的蔓延,COVID-19疫情目前正受到全球科学家的广泛关注和研究。


当前,我国有关2019-nCoV疫情的数据主要由权威机构发布,包括国家卫生健康委员会(简称国家卫健委)和各省、自治区的卫生健康委员会(简称省卫健委)。然而,国家和省卫健委发布的数据或信息仅以文本通告,因该数据未与地理空间数据建立关联,不便于空间分析。虽然也有诸多平台(如丁香园和人民网等)通过爬取国家和省卫健委的数据实现2019-nCoV疫情的实时动态可视化,但是上述平台仅显示实时数据,无法直观展现疫情演变的时空变化,且较难直接获取疫情历史发展的时空数据,不利于今后科学工作者针对疫情作回顾性分析。


因此,本研究旨在为广大科研工作者提供权威的、开放的和多尺度的新型冠状病毒(COVID-19)时空数据集,有助于服务全球科学家为本次疫情建言献策。该数据涵盖3种不同的尺度的COVID-19数据集和矢量地图,包含6种疫情统计信息。




数据介绍
【数据分享】COVID-19疫情时空数据集及典型应用丨城市数据派


此次和大家分享的COVID-19疫情时空数据集拟提供从2019年12月31日至疫情结束期间的全球多尺度新型冠状病毒(COVID-19)疫情的时空数据。


COVID-19时空数据集获取方式:

关注城市数据派微信号

在微信号里回复 “ 227 ” 三个数字

即可获得下载地址


该数据集包括三个尺度,即全球尺度、全国(省级)尺度和全国(地级市)尺度的统计数据。目前公布的数据涉及以下几类:新增确诊、新增死亡、新增疑似、新增治愈、现有确诊、累计治愈、累计死亡、累计确诊、现有疑似,由于大部分省级和地市级地区卫健委尚未公布现有确诊和现有疑似的信息,因此本研究仅统计每个尺度共有的6个属性,即新增确诊病例、新增治愈病例、新增死亡病例、累计确诊病例、累计治愈病例和累计死亡病例。




数据来源
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COVID-19疫情时空数据集中,有关COVID-19全球疫情数据(中国以外)来源于人民网(中国十大权威互联网平台之一),数据展示如图1。


人民网网址:

http://society.people.com.cn/GB/369130/431577/index.html 


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▲ 图1:人民网境外数据展示截图
(2020.2.21,22:15)


COVID-19中国(省和地级市)疫情数据来源于国家、省和自治区的卫生与健康委员会(简称卫健委)。该数据集拟每周日进行更新,更新具体来源如表1所示。


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▲ 表1:COVID-19时空数据集制作与更新来源






数据格式
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疫情数据以文本格式(.txt)记录(如表2)。第一行是属性字段,包括国家、省或城市的中文和英文名、日期(如2020年2月4日记录为T20200204)。第二行起记录各属性字段的值。例如,武汉市2020年2月4日新增治愈病例65例,咸宁市2020年2月4日新增治愈病例0例。需要说明的是:“-1”代表当日卫健委未公布该地区的详细数据。


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▲ 表2:文件格式——以新增治愈病例为例




使用说明
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首先,该数据集可用于制作COVID-19疫情的时序变化图(如图2示例)。其次,以矢量数据为底图,可以制作全球、中国(省级)和中国(地级市)尺度下疫情数据的时空演化图(如图3-5)。

全球矢量数据可以从Database of GlobalAdministrative Areas(GADM)网站获取,该数据是一个免费的、高分辨率、高精度的全球行政区划数据库;中国(省和地级市)矢量数据可以从全国地理信息资源目录服务系统网站获取。

GADM网站地址:
https://gadm.org/download_world.html

全国地理信息资源目录服务系统网站地址:

http://www.webmap.cn/commres.do?method=dataDownload


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▲ 图2:基于COVID-19疫情时空数据集制作的时序变化图



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▲ 图3:基于COVID-19疫情时空数据集制作的时序变化图(全球尺度)

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▲ 图4:基于COVID-19疫情时空数据集制作的时空演化图(全国省级尺度)


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▲ 图5:基于COVID-19疫情时空数据集制作的时空演化图(全国地级市尺度)




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原文始发于微信公众号(城市数据派):【数据分享】COVID-19疫情时空数据集及典型应用丨城市数据派

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